معرفی

تغییرات اپی ژنتیک مانند 5 متیلاسیون کربن سیتوزین، نقش ضروری در شروع و رشد بیماری های انسان دارد. برای بدست آوردن بینش برای تاثیر الگوی متیلاسیون DNA در ژنوم ( به نام متیلوم) ارزیابی کمی حالت‌های متیلاسیون تمام سایت‌های CpG در ژنوم ضروری است. توالی یابی بی سولفیت کل ژنوم (WGBS) امکان بررسی جامع متیلاسیون DNA در کل ژنوم را فراهم می کند. (Masako Suzuki, 2018)

از زمان کاربرد اولیه آن در سال 1992، توالی یابی بی سولفیت DNA (BS) به عنوان استاندارد طلایی برای تجزیه و تحلیل متیلاسیون DNA عنوان شده است. متد BS باعث تبدیل سیتوزین های اصلاح نشده به اوراسیل می شود، در حالی که اصلاح 5 متیل سیتوزین را حفظ می کند. در ادامه با PCR و توالی یابی، این امکان برای نقشه برداری با وضوح تک باز فراهم می شود.(Olova, 2018)

این شرکت خدمات جامع توالی‌یابی بی سولفیت کل ژنوم (WGBS) را ارائه می‌دهد که امکان شناسایی کارآمد سیتوزین‌های متیله در کل ژنوم با وضوح تک نوکلئوتیدی را فراهم می‌کند.
اکتشاف کامل متیلوم برای به دست آوردن بینش در مورد بیان ژن و فرآیندهای بیولوژیکی مختلف تحت تأثیر تنظیم اپی ژنتیک بسیار مهم است.

کاربردهای توالی یابی بی سولفیت کل ژنوم

این شرکت داده های قابل اعتماد و نتایج تجزیه و تحلیل را از خدمات WGBSبرای حمایت از تحقیقاتی مانند:

  • الگوهای متیلاسیون در مکان های CG، CHG، و CHH با تفکیک تک نوکلئوتیدی
  • تشخیص موقعیت های متیله متفاوت مرتبط با داروهای مورد بررسی یا شرایط نمونه
  • شناسایی مکانیسم های زیربنایی تمایز سلولی یا توسعه بافت بر اساس خطوط متیلاسیون
  • امکان تشخیص زودهنگام بیماری ها و سرطان ها با تشخیص هیپرمتیلاسیون یا هیپومتیلاسیون DNA

Benefits of Company WGBS Service

  • We have successfully concluded numerous projects, delivering data of exceptional quality suitable for publication, along with thorough bioinformatics analysis.
  • Our methylation library preparation offers the advantage of ultra-low input DNA and a high bisulfite conversion rate.
  • Utilizing industry-standard software like Bismark and established in-house pipelines ensures precise mapping and comprehensive bioinformatics analysis.
  • Customized association analyses can investigate connections between methylation patterns and gene expression.
  • With the decreasing costs of Next-Generation Sequencing (NGS), the WGBS approach is becoming more accessible for both fundamental and clinical research (Olova, 2018)

WGBS Specifications: DNA Sample Requirements

Project Workflow of Genoxvision WGBS Service

The WGBS service offered by the Genoxvision follows a four-step process. It begins with sample preparation, progresses to library preparation, sequencing, and concludes with bioinformatics analysis. The construction of a methylation library involves DNA fragmentation and the conversion of unmethylated cytosines to uracils through sodium bisulfite treatment. Subsequently, advanced technology is used for sequencing, and the resulting reads undergo processing via bioinformatics pipelines.

To guarantee the precision and dependability of sequencing data, the company rigorously audits each experimental step through quality control measures. It ensures high-quality data output at every stage, starting from DNA sampling and extending to the generation of the final data report. The attainment of high-quality data is essential to ensure that bioinformatics analysis is accurate, thorough, and realistic.