معرفی

منظور از ترانسکریپتوم جمع آوری تمامی نسخ رونویسی شده RNA در یک سلول در حین توسعه از مرحله مشخص یا شرایط فیزیولوژیک خاص می باشد. درک رونوشت برای تفسیر اجزای عملکردی ژنوم و به دست آوردن بینش در مورد مکانیسم های اساسی که منجر به توسعه و کمک به بیماری می شود بسیار مهم است.(Yang, 2015)

سرویس توالی‌سازی کامل رونویسی ارائه‌شده توسط این شرکت، محققان را با راه‌حل‌های پیشرفته توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) توانمند می‌سازد، که امکان تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک جامع همه رونوشت‌های RNA، شامل mRNA و RNA غیر کدکننده (lncRNA, sRNA, circRNA)را فراهم می‌کند.

این سرویس با استفاده از یک استراتژی توالی یابی زوجی، امکان تعیین کمیت دقیق سطوح ژن و رونوشت، شناسایی انواع اسپلایس و کشف ویژگی های جدید در رونوشت را فراهم می کند. این رویکرد رقابتی به مکانیزم‌های شبکه رونویسی و تنظیم کننده بالقوه می‌پردازد و بینش‌های ارزشمندی را در مورد عملکردهای تعامل از یک دیدگاه جامع رونویسی ارائه می‌دهد.

موارد کاربرد توالی هول ترانسکریپتوم

  • مطالعه هر دو mRNA و RNA غیر کد کننده (ncRNA) در یک آنالیز.
  • تحقیق در مورد اسفنج miRNA و مبانی تنظیمی هدف.
  • بررسی شبکه های رگولاتوری در بین جفت های ژن – lncRNA/circRNA/miRNA (Zeng, 2023)

Benefits of Whole Transcriptome Sequencing

  • Compared to mRNA-seq, lncRNA-seq, sRNA-seq, and circRNA-seq, Whole Transcriptome Sequencing offers a more thorough analysis of the transcriptional regulation network.
  • Researchers benefit from Whole Transcriptome Sequencing in identifying biomarkers across a wide spectrum of transcripts.
  • WTS facilitates the identification of both detected and novel features.
  • It enables comprehensive profiling of the entire transcriptome across a broad dynamic range. (Jiang,
    2015)

WTS Specifications: RNA Sample Requirements

The Workflow for the Whole Transcriptome Sequencing Service offered by the our company a systematic process:

  1. Sample Quality Control (Sample QC): The initial step involves assessing the quality of the samples to ensure they meet the criteria for RNA-Seq techniques.
  2. Library Preparation: Following Sample QC, the appropriate library is prepared based on the target organism. The prepared library undergoes testing for its quality (Library QC).
  3. Sequencing Strategy: A paired-end 150 bp sequencing strategy is employed for the lncRNA and circRNA library, while single-end 50 bp sequencing is used for the small RNA library.
  4. Data Quality Control (Data QC): The obtained data undergoes rigorous quality control procedures to guarantee the overall quality.
  5. Bioinformatic Analyses: Finally, comprehensive bioinformatic analyses are conducted, and the results are provided in a format ready for publication. The step-by-step protocol is illustrated in the following flowsheet.