معرفی

از این روش برای پروفایل کردن پروتئین های متصل شونده به DNA ، هیستون مدیفیکیشن استفاده می شود. پیشرفت‌ها در فناوری NGS به طور قابل‌توجهی Chip-seq را بهبود بخشیده است، وضوح بهتر، کاهش نویز و پوشش گسترده‌تر را در مقایسه با روش چیپ-Arrayارائه می‌کند. (Park, 2009)

کاهش هزینه های توالی یابی، ChIP-seq را به ابزاری ضروری برای بررسی تنظیم ژن و درک مکانیسم های اپی ژنتیک تبدیل کرده است.
ما در شرکت ژنوکس ویژن، توالی یابی سطح بالا و راه حل های بیوانفورماتیک جامعی را که برای پروژه های ChiP-seq شما طراحی شده است، ارائه می دهیم.

موارد کاربرد توالی یابی ایمونوپرسپیتیشن کروماتین

  • بررسی تنظیم ژن‌ها با پروفایل کردن مکان‌های اتصال در سطح ژنوم و تجزیه و تحلیل موتیف برای درک دخالت فاکتور رونویسی
  • ایجاد نقشه از الگوی هیستون مدیفیکیشن ها
  • بررسی تعامل بین پروفایل های اپی ژنتیک و مقررات رونویسی از طریق تجزیه و تحلیل مشترک
  • انجام تجزیه و تحلیل تقویت کننده و ارائه حاشیه نویسی وضعیت کروماتین در سطح ژنوم (Nakato, 2020)

Benefits

  • The generated data exhibits stability and reliability, ensuring high-quality sequencing with a guaranteed Q30≥ 80% sequencing score.
  • Our expert bioinformatics analysis employs industry-standard MACS2 software and utilizes the latest program version for tasks such as motif prediction, peak annotation, functional analysis, and data visualization.
  • Complementary analyses are offered to investigate connections between ChIP-seq results and gene expression.

ChIP-seq Specifications: DNA Sample Requirements

Project Workflow of Genoxvision ChIP-seq Service

The ChIP-seq service offered by the company involves four key stages: sample preparation, DNA library preparation, Illumina PE150 sequencing, and data analysis through bioinformatics pipelines. The quality and quantity of data output, crucial for subsequent bioinformatics analysis results, can be directly influenced at each step from DNA sampling to data report generation.

Stringent checks are conducted at every stage, encompassing sample quality control, library quality control, and sequencing data quality control. These measures are implemented to guarantee the sequencing data’s high quality, accuracy, and reliability, ensuring a comprehensive and reliable outcome.