معرفی

توالی یابی RNA افق های جدیدی در زمینه رونویسی ژن را برای محققان به ارمغان آورده است. از طریق استفاده از تکنیک های دقیق و لود بالای NGS توالی یابی RNA پروفایل بیان ژن و جهش های رونویسی در سلول را نشان میدهد. در این روش mRNA تک رشته ایی بطور انتخابی گرفته شده و سپس طی تهیه لایبرری به cDNA (کمپلیمنتاری ) تبدیل می شود. (Corney, 2013)

 

موارد کاربرد توالی mRNA

  • آنالیز کمی رونویسی ها در نمونه ها و بافت های مختلف در بیماری ها و درمان های مختلف.
  • شناسایی رونویسی های جدید، برش های جایگزین(alternative splicing) و جهش های در رونویسی.
  •  اکتشاف مکانیسم های توسعه و مقاومت دارویی با کمک رونویسی های مختص بافت و یا بیان ژن.
  • شناسایی بایومارکر های نوین از طریق رونویسی ها و شناسایی SNP/InDelو فیوز های ژنی.
  • آنالیز سایر داده های امیک(omics) در کنار رونویسی
  • آزمون مکانیسم های بیماری زایی و تحت بالینی جهت تشخیص پزشکی. (Kumar, 2012)

Benefits of Company mRNA Sequencing

The mRNA sequencing services provided by the Genoxvision boast high throughput and accuracy, achieving a Q30 score of ≥ 85%. This is complemented by a low initial RNA input requirement. With a wealth of experience, Genoxvision has successfully executed numerous RNA-Seq projects, assisting multiple researchers in publishing their work in high-impact factor journals.

The company provides comprehensive solutions encompassing quantification, analysis of differential gene expression, annotation of novel transcripts, exploration of alternative splicing, discovery of fusion genes, and identification of other potential variations. Skillful bioinformaticians deliver data ready for publication through customized pipelines tailored to species, whether they have a reference genome or not.

mRNA-seq Specifications: Sample Requirements

Project Workflow of Company mRNA-seq Services

The project workflow initiates with sample quality control (Sample QC) to verify that your samples adhere to RNA-Seq technique criteria. Subsequently, a suitable library is crafted based on your target organism and application, and its quality is examined (Library QC). Following that, a 150 bp paired-end sequencing strategy is employed to sequence the samples, with the resulting data undergoing quality assessment (Data QC). Finally, bioinformatic analyses are conducted, and publication-ready results are furnished. The step-by-step protocol of our mRNA-seq technique is outlined in the following flowsheet.

Sample preparation is succeeded by RNA library construction. The RNA library is generated through polyA capture (or rRNA removal) and reverse transcription of cDNA. The sample is then sequenced using Illumina PE150 technology, and the concluding step involves bioinformatics analysis.